1.預洗階段
沖洗污垢：利用最后沖洗后殘留在水箱中的水，對動物籠、籠子等的表面進行初步沖洗，去除大量的污垢、雜質以及一些容易脫落的污染物，為后續的清洗工作提供一個相對清潔的基礎。
排出污水：將沖洗下來的含有污垢的水排出，避免污染物在后續清洗過程中再次附著或影響清洗效果。
2.主洗階段
清潔劑添加：從可選的清潔劑溶液存儲槽中排出適量的清潔劑溶液至再循環水槽，使清潔劑與水充分混合，形成具有一定清潔能力的清洗液。
深度清潔：清洗液在水泵的作用下，通過噴淋系統對籠具等進行*方位的噴射和浸泡，使清潔劑能夠深入到物體表面的縫隙和難以觸及的部位，分解和去除頑固的污漬、細菌、病毒等有害物質。
3.二次清洗（酸洗）階段
酸液注入：根據需要，從可選的酸溶液儲罐中排放適量的酸溶液至循環水罐中，與清洗液進一步混合。酸溶液可以增強對某些特定污染物的清洗效果，尤其是對于一些堿性物質或礦物質沉淀等。
強化清洗：酸洗液在循環系統的作用下，繼續對籠具等進行清洗，進一步提高清洗的徹*性和潔凈度。
4.沖洗階段
清水置換：用新鮮的熱水注滿水箱，通過噴淋系統進行循環沖洗，將之前使用的清潔劑和酸洗液徹*沖洗干凈，確保不會殘留對實驗動物有害的物質。
多次沖洗：通常會進行多次沖洗，以保證清洗的效果和質量，直到排出的水達到一定的清潔標準。
5.干燥階段
熱風干燥：部分洗籠機配備有熱風干燥系統，在沖洗完成后，會吹入熱風，加速籠具表面的水分蒸發，使其快速干燥，防止因潮濕而滋生細菌或產生異味。
自然干燥：如果沒有熱風干燥系統，也可以將清洗干凈的籠具在通風良好的地方自然晾干。
6.排氣階段
蒸汽排出：在完成所有的清洗操作后，自動排氣風門打開，將清洗過程中產生的蒸汽排放到用戶的空氣處理系統中，避免蒸汽在設備內部積聚，影響設備的正常運行和使用壽命。
